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核酸检测报告说未检出 核酸检测报告未审核什么意思

本文目录

  1. 核酸检测报告未审核什么意思
  2. 新冠疫苗接种证明可以替代核酸检测报告吗
  3. 什么是新冠肺炎病毒核酸检测结果的Ct值
  4. 基因突变在临床病理检测报告中的书写规范

一 、核酸检测报告未审核什么意思

核酸检测主要是通过咽拭子取样检测。也就是说用柔软的棉签在咽后壁以及双侧扁桃体不断的旋转 ,然后在取得明显的分泌物以后放入试管中,旋紧试管的盖子,然后将试管用密封袋装好 。那么 ,核酸检测结果显示未检出是什么意思?

1.核酸检测结果显示未检出是什么意思

核酸检测未检出说明患者的结果呈阴性,如果进行的是新冠肺炎病毒的核酸检测及表示患者未感染新冠肺炎。核酸检测一般情况下是通过对患者的鼻咽拭子、痰液或支气管灌洗液等标本进行检测,观察其中是否出现脱氧核糖核酸和核糖核酸 ,由于新冠肺炎病毒中仅含有核糖核酸,因此结果如果呈阳性时说明患者可能感染了新型冠状病毒。建议患者做好防护措施,避免出入人流密集的场所 。

2.做核酸检测为什么会出现呕吐状况

在做核酸检测时需要到咽喉部位进行黏膜采样 ,会对咽喉部位造成 *** 出现咽反射症状 ,如果在做核酸测试前有进食的话,一 *** 咽喉部就很容易呕吐。所以一般规定在取样前2小时需要禁食。如果在做核酸检测期间有出现感冒或者是胃肠道等疾病的话,也可能会出现呕吐症状 。再加上做核酸检测时对咽喉部位的 *** ,就会更容易出现呕吐症状。

二、新冠疫苗接种证明可以替代核酸检测报告吗

接种新冠病毒疫苗后,由于以下原因,受种者极少数因保护失败仍出现核酸检测阳性或发病:1.全程接种疫苗后 ,个别因免疫失败而未获得有效保护,这部分人群暴露于新冠病毒后,可能因感染新冠病毒而检出核酸阳性或发病。

2.疫苗接种后需要一段时间才能产生保护效果 。

如果这段时间内感染新冠病毒 ,可能检出核酸阳性或发病 。

3.处于疾病潜伏期的患者或无症状感染者,即使接种疫苗,仍可能因已被感染而检出核酸阳性或发病。

上述人群有可能成为传染者 ,在新冠疫情防控需要进行核酸筛查时,新冠病毒疫苗接种证明不能替代核酸检测报告,还需配合相关部门进行核酸检测。

核酸检测报告说未检出 核酸检测报告未审核什么意思

(图片来源于 *** 侵删)

三 、什么是新冠肺炎病毒核酸检测结果的Ct值

为更好地普及医院感染防控知识和便于理解与执行疫情防控措施 ,今天带你了解什么是新冠肺炎病毒核酸检测结果的Ct值 。

今日一学

问什么是新冠肺炎病毒核酸检测结果的Ct值?

答新冠肺炎病毒核酸检测通常采用实时荧光反转录PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction ,RT-PCR)的 *** 。结果中可能未出现Ct值。Ct值(Cycle threshold,循环阈值)是指每个反应管内的荧光信号到达设定的检测阈值时所经历的循环数 。研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数(也就是通常所说的“量 ”)的对数存在线性关系 ,起始拷贝数越多,Ct值越小;反之亦然。

——《医学分子生物学》第2版,江苏凤凰科学技术出版社 ,张向阳主编,2018年

目前新冠肺炎病毒核酸检测主要针对新冠病毒基因组中开放读码框1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)和核壳蛋白(nucleocapsid protein ,N)进行检测。其检测结果判定在《新型冠状病毒肺炎防控方案》第七版之前均为:

①阴性:无Ct值或Ct≥40 。

②阳性:Ct值<37,可报告为阳性。

③灰区:Ct值在37-40之间,建议重复实验 ,若重做结果Ct值<40,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性 ,否则为阴性。

④注:如果用的是商品化试剂盒 ,则以厂家提供的说明书为准 。

阳性时,Ct值越低意味着病毒核酸的拷贝数越多(通常可以理解为病毒量越多),也提示其受检者的传染性越强。

由于商品化检测试剂盒种类越来越多 ,各自设定检出限和灰区的值可能存在差异,因此自《新型冠状病毒肺炎防控方案》第八版起,检测结果判定改为:

①阴性:无Ct值、无S形扩增曲线。

②阳性:Ct值小于等于检出限 ,且有S形扩增曲线,可报告为阳性 。

③灰区:Ct值位于灰区,建议重复实验 ,若重做Ct值仍处于灰区,但出现明显的S形扩增曲线,该样本判断为阳性 ,否则为阴性 。

④注:如使用商品化试剂盒,则以厂家提供的说明书为准。

——《新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)附件10—新冠病毒样本采集和检测技术指南》

正文太长不想看,只看结论版:

不论怎样改变 ,我们只需记住一点:CT值越小表明达到设定阈值所需的循环数越少 ,代表病毒载量越高。

举个“栗子”:

如果我们看到这样的报道:

上述两例初筛阳性病例的CT值36、18和39 、19分别代表新冠病毒核酸ORF1ab基因和N基因检测时荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数,CT值越小,病毒载量越高 ,传播性越强,因此病例4的史某某检测出的新冠病毒载量相对于病例3的高某来说要高的多,病例4的传播性强 。

需要注意的是 ,新冠核酸检测结果阴性不能排除新冠病毒感染,需要排除可能产生假阴性的因素,包括:样本质量差 ,比如口咽等部位的呼吸道样本;样本收集的过早或过晚;没有正确的保存、运输和处理样本;技术本身存在的原因,如病毒变异、PCR抑制等。

四 、基因突变在临床病理检测报告中的书写规范

基因突变在临床病理检测报告中的书写规范,主要参考卫计委临检中心的结果回报要求。报告中使用的参考基因组版本为GRCh37(hg19) ,此版本在临床用途上将持续使用,直到未来有新的替代版本出现 。

在书写突变位点时,必须以参考基因组为准。突变位点的位置 、cHGVS、pHGVS应根据人类基因组变异协会(HGVS)的基因突变命名规则进行汇报。所有变异都应按照靠近基因转录方向末端(3’端)的位置来表述(3’rule) 。

具体书写规范如下:

单核苷酸变异(SNV):如EGFR T790M突变 ,其染色 *** 置应填写突变在参考基因组染色体上的位置 ,即Start和End两个值一致。

插入变异(Insertion):如EGFR c.2308_2309insGTT突变,Start位置填写插入片段到参考基因组上碱基的位置,例如chr7:55249010 ,说明GTT片段插入到了这个碱基后面,End位置填写英文半角字符的短横线,参考基因组序列也填写英文半角字符的短横线。

缺失变异(Deletion):如EGFR c.2237_2254del18突变 ,Start位置填写缺失片段在参考基因组上的起始位置,End位置填写缺失片段在参考基因组上的终止位置 。缺失片段请严格按照其在基因组的起始和终止位置进行填写,不要添加任何未缺失的碱基。Alt请填写英文半角字符的短横线。

替换变异(Substitution):多碱基替换不能分开汇报 ,如PAX5 p.Ala268Asp突变,正确的回报格式应为 。

如果实验室检测样本为阴性(未检出体细胞突变),则按照以下方式进行结果回报:

Chr列:填写突变所在的染色体编号 。

Start列:填写突变发生位点 ,以GRCh37(hg19)版本的人类参考基因组上的基因组坐标。

End列:填写突变结束位点,以GRCh37(hg19)版本的人类参考基因组上的基因组坐标。

Ref列:填写GRCh37(hg19)版本的人类参考基因组上该处的参考碱基 。

Alt列:填写样本在该基因组坐标处的突变后碱基。

Gene列:填写发生突变的基因名,使用人类基因组组织基因命名委员会(HUGO Gene Nomenclature Committee)推荐的常用名。

Type列:填写SNV、Insertion 、Deletion或Complex 。

长1kb以上的插入和缺失算作SV的亚分类。

Transcript列:填写人类基因组变异协会(HGVS)规定的用于标识该突变所使用的该基因的编码链 ,根据Clinvar的转录本ID进行填写。推荐使用Clinvar中主转录本的最新版本 。注意:Clinvar的转录本编号必须有版本号 ,如NM_005228.5中的.5。

cHGVS& pHGVS列:填写人类基因组变异协会(HGVS)规定的对突变的描述,推荐参考ClinVar的写法,所有变异都应按照靠近基因转录方向末端(3’端)的位置来表述(3’rule)。

VAF(%)列:填写样本中Alt的占比 ,数值范围为[0,100],保留两位小数,无百分号 。

Consequence(s)(突变类型)列:填写Nonsense substitution、Missense substitution或Synonymous substitution。其中Nonsense substitution代表碱基变化处产生了新的终止密码子 ,将导致肽链合成提前结束;Missense substitution代表碱基变化所属的密码子对应的氨基酸发生改变;Synonymous substitution代表碱基变化所属的密码子对应的氨基酸维持不变。

对于插入和缺失,根据是否导致蛋白质读码框改变,填写Inframe insertion、Frameshift insertion 、Inframe deletion或Frameshift deletion 。对于影响多个密码子的多碱基替换 ,填写Complex mutation 。

对于剪接点改变,填写Splice Site mutation。

其他情况填写Other。

Affected Exon(s):描述突变影响该基因的哪些外显子,格式为突变所在外显子序号/基因外显子总数 。计算外显子序号和总数所使用的转录本与Transcript列保持一致 ,推荐使用Clinvar中的主转录本最新版本。

注意事项:回报Start, End位置时,正链基因上的突变,遵循HGVS在转录本和蛋白质层面的3’rule原则 ,回报其对应到基因组上的位置信息;负链基因上的突变 ,同样遵循HGVS在转录本和蛋白质层面的3’rule原则,回报其对应到基因组上的位置信息。

总结,基因突变的临床病理检测报告规范要求详细 ,需要对参考基因组、突变位点、基因 、碱基变化类型、突变类型、影响的外显子 、占比、突变类型等信息进行详细描述和填写,以确保报告的准确性和可理解性 。同时,遵循HGVS的命名规则和3’rule原则 ,对于不同的变异类型进行正确的分类和描述,对于提升检测结果的准确性和临床应用具有重要意义。

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